Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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