Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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