Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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