Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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