Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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LRRTM2O43300 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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LRRTM2O43300 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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LRRTM2O43300 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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