Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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BIVM-ERCC5R4GMW8 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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BIVM-ERCC5R4GMW8 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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BIVM-ERCC5R4GMW8 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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BIVM-ERCC5R4GMW8 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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