Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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