Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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