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| CHD4 | Q14839 | AC243960.3-202 | ENST00000599770 | 594 nt | TSL 4 BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | RAD51B-210 | ENST00000487270 | 2596 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | BLOC1S2-205 | ENST00000614731 | 2634 nt | TSL 2 BASIC | 7.47 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | CNTRL-207 | ENST00000373855 | 7660 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 7.47 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | LRRTM3-201 | ENST00000361320 | 4358 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.47 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | HGF-205 | ENST00000423064 | 1990 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | FAM186A-201 | ENST00000327337 | 7127 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZNF578-201 | ENST00000421239 | 2017 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | ERLIN2-211 | ENST00000523887 | 2347 nt | TSL 2 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZNF542P-202 | ENST00000467807 | 3209 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | CC2D2B-202 | ENST00000410012 | 1792 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | CAST-203 | ENST00000338252 | 2972 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | UTY-209 | ENST00000537580 | 6490 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR7D4-202 | ENST00000641244 | 4968 nt | APPRIS P1 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | CDKAL1-202 | ENST00000378610 | 3115 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZC3H11A-204 | ENST00000367214 | 3451 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR4D5-201 | ENST00000307033 | 1095 nt | APPRIS P1 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | USMG5-201 | ENST00000309579 | 364 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | ATP2B4-204 | ENST00000367218 | 8918 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AC011753.3-201 | ENST00000443436 | 406 nt | BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | BMPR1B-204 | ENST00000502683 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC007370.1-201 | ENST00000503163 | 316 nt | TSL 2 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |
| CHD4 | Q14839 | HHIP-AS1-203 | ENST00000512359 | 646 nt | TSL 3 BASIC | 7.46 | □□□□□ -1.22 | | |