Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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