Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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