Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ZBTB43-201ENST00000373457 5695 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms