Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MYH2-202ENST00000397183 6078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CORO2A-201ENST00000343933 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ATL3-201ENST00000398868 7135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CNTN4-205ENST00000427331 4980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SEMA6D-203ENST00000355997 5908 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 JADE1-214ENST00000611140 5648 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ITIH6-201ENST00000218436 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TTC30A-201ENST00000355689 5975 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SLC6A15-201ENST00000266682 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.8 ms