Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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