Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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