Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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