Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms