Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ZNF439Q8NDP4 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ZNF439Q8NDP4 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ZNF439Q8NDP4 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ZNF439Q8NDP4 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ZNF439Q8NDP4 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ZNF439Q8NDP4 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF439Q8NDP4 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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