Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC02549-201ENST00000445346 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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FXNQ16595 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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FXNQ16595 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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FXNQ16595 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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FXNQ16595 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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FXNQ16595 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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