Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.5 ms