Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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BRD3Q15059 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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BRD3Q15059 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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BRD3Q15059 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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