Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 IL24-207ENST00000611909 1621 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AP001527.1-201ENST00000566440 1957 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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