Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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