Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
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PTPRMP28827 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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PTPRMP28827 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
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PTPRMP28827 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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PTPRMP28827 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
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PTPRMP28827 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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PTPRMP28827 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRMP28827 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
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