Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 LINC01185-201ENST00000439412 554 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC113143.2-201ENST00000603849 394 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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BCL11BQ9C0K0 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC000036.1-201ENST00000449652 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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BCL11BQ9C0K0 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 ARID5B-202ENST00000309334 3141 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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BCL11BQ9C0K0 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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BCL11BQ9C0K0 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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BCL11BQ9C0K0 LNP1-203ENST00000489752 1813 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 OR9K2-201ENST00000305377 1122 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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BCL11BQ9C0K0 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CHCHD3P2-201ENST00000550751 639 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 GMFG-204ENST00000595636 487 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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