Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms