Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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