Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHD4Q14839 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms