Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC087379.2-201ENST00000532242 471 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RN7SL468P-201ENST00000582256 294 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC048344.3-201ENST00000605512 251 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DNAJC5B-201ENST00000276570 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 STON2-201ENST00000267540 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ARMC3-201ENST00000298032 2811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF185-203ENST00000324823 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CYP4A22-202ENST00000371890 1780 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 GIMAP2-201ENST00000223293 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ANKFN1-202ENST00000566473 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 NRG3-204ENST00000404576 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 BCO2-201ENST00000357685 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PROX2-202ENST00000556489 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RSPO2-203ENST00000517939 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ADIPOQ-AS1-201ENST00000422718 3443 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RN7SKP26-201ENST00000410247 293 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RN7SL418P-201ENST00000473031 287 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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