Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SALL1Q9NSC2 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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