Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 VIT-203ENST00000389975 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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