Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms