Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SYNE4Q8N205 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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