Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AL034376.2-201ENST00000568110 573 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
C16orf54Q6UWD8 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms