Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL357518.1-201ENST00000607169 430 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP004247.4-201ENST00000608484 942 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RHOXF1P3-201ENST00000635058 502 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR55B1P-202ENST00000641245 1276 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC089987.1-202ENST00000641959 426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NLRC4-201ENST00000342905 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MLH1-222ENST00000539477 2366 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FER-209ENST00000618353 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL390728.4-201ENST00000421406 1465 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SFR1-202ENST00000369729 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CEACAMP3-201ENST00000473762 1548 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF432-201ENST00000221315 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 VSIG4-201ENST00000374737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IL1A-201ENST00000263339 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RPS10-202ENST00000344700 650 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 DCTN3-204ENST00000378913 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC11-202ENST00000424784 943 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PTMAP4-201ENST00000426188 346 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL359541.1-201ENST00000431097 575 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL109659.1-201ENST00000431986 651 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CSTP1-201ENST00000433681 419 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TTC28-AS1-216ENST00000437713 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FAR2P3-205ENST00000447059 604 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC092634.4-203ENST00000451395 448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC00307-201ENST00000451410 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 C6orf52-204ENST00000460742 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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