Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OR6N2-201ENST00000339258 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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