Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.5 ms