Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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