Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms