Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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