Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GDAP2Q9NXN4 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms