Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms