Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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