Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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