Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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