Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms