Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RN7SKP173-201ENST00000362821 315 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL160290.1-201ENST00000415509 416 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC243962.1-201ENST00000441512 579 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MRVI1-AS1-201ENST00000525578 829 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TBC1D29-201ENST00000579181 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RN7SL619P-201ENST00000581753 258 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TBC1D29-204ENST00000584297 602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC084876.1-201ENST00000612793 641 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MEIS1-216ENST00000560281 2773 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MSRB3-212ENST00000614640 4270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PABPC4L-201ENST00000421491 4944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CAB39L-202ENST00000355854 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PRSS51-203ENST00000636217 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC01692-201ENST00000441009 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 THNSL1-202ENST00000524413 3788 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 2102 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 XRCC6P1-201ENST00000420392 1805 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TMEM108-AS1-202ENST00000505721 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MICB-204ENST00000538442 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SP140-202ENST00000373645 814 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC015977.2-201ENST00000420852 567 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC012594.1-235ENST00000424391 727 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RPL10P6-201ENST00000457497 318 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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