Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXC1Q12948 USP2-AS1-201ENST00000498979 2486 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXC1Q12948 ADGRF4-202ENST00000327753 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 AL392183.1-201ENST00000606622 2436 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXC1Q12948 AC010200.1-201ENST00000547380 1454 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXC1Q12948 NR4A2-201ENST00000339562 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 AOAH-211ENST00000617537 2381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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FOXC1Q12948 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
FOXC1Q12948 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
FOXC1Q12948 FBXO36-201ENST00000283946 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
FOXC1Q12948 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
FOXC1Q12948 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
FOXC1Q12948 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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