Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 NCAM1-222ENST00000615285 6045 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 FAM71F2-205ENST00000641605 5749 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SEMA3E-201ENST00000307792 6476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PLCXD2-205ENST00000636933 7710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms