Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms